Theo hợp đồng đã ký năm 2008 đối với việc thu phí trên trạm này là: “Mức phí 2 năm đầu thu bằng mức quy định tại Thông tư số 90/2004/TT-BTC ngày 7/9/2004 của Bộ Tài chính hướng dẫn chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí đường bộ; từ năm thứ 3 mức phí bằng 1,5 lần so với quy định”.
Trạm thu phí Bắc Thăng Long - Nội Bài chính thức bàn giao cho nhà Ok9 cool link đăng nhập thu phí hoàn vốn từ ngày 1/1/2011, mức thu hiện hành áp dụng theo Thông tư số 90/2004/TT-BTC. Như vậy, từ ngày 1/1/2013, trạm Bắc Thăng Long - Nội Bài sẽ được phép thực hiện mức thu phí mới tăng lên 1,5 lần so với hiện nay