Để bảo vệ tốt nhất quyền và lợi ích của người lao động khu vực này cần phải thúc đẩy thương lượng, ký kết thỏa ước tập thể. Tuy nhiên, hầu hết DN vừa và nhỏ hiện nay không đủ điều kiện thành lập công đoàn. Ý kiến của nhiều DN vừa và nhỏ cho rằng, đối với loại hình DN này thì việc thành lập công đoàn cơ sở ghép hoặc công đoàn cơ sở cụm DN là rất cần thiết. Tuy nhiên Luật Lao động và Luật Công đoàn chưa đề cập đến mô hình này.
Bên cạnh đó, việc thương lượng thỏa ước lao động tập thể ngành cũng gặp không ít khó khăn thách thức vì không có đại diện giới chủ sử dụng LĐ ở cấp ngành để thương lượng tập thể với đại diện người LĐ của ngành là công đoàn ngành. Đây là một trong những bất cập dẫn đến tình hình tranh chấp lao động ngày càng phức tạp
