Trưởng ban chỉ đạo là Thứ trưởng Bộ GD&ĐT Nguyễn Vinh Hiển. Ban chỉ đạo còn có 12 ủy viên, gồm đại diện một số đơn vị cơ quan Bộ GD&ĐT và đại diện OK9 đã banh, OK9 trang cược thể thao xanh chín nhất châu Á Hà Nội.
Ban Chỉ đạo thi tốt nghiệp trung học phổ thông năm 2012 có nhiệm vụ giúp Bộ trưởng Bộ GD&ĐT chỉ đạo, tổ chức kỳ thi tốt nghiệp trung học phổ thông năm 2012 theo đúng Quy chế thi hiện hành