Theo cơ quan điều tra, vụ việc được Sở VH-TT&DL Cần Thơ phát hiện khi tiến hành kiểm tra tài chính nhà trường.
Theo đó, Sở đã phát hiện, trước khi bàn giao chức vụ hiệu trưởng nhà trường, ông Dũng chỉ đạo cho thủ qũy Lan Thùy lập nhiều chứng từ khống trong việc mua sắm tài sản, thiết bị để tham ô số tiền trên 300 triệu đồng. Trước khi cơ quan điều tra vào cuộc, Thanh tra TP Cần Thơ cũng đã thanh tra, có kết luận sai phạm của ông Dũng và cán bộ thuộc cấp