Theo điều tra của tổ liên ngành, có trên 10 loại phí đã bị các chủ tàu nước ngoài lạm thu. Đơn cử như phí dịch vụ container THC (phí trả cho bến bãi đối với hàng nguyên container) vốn do cảng thu, nhưng thực tế hiện nay các chủ tàu thu trực tiếp từ chủ hàng và nộp cho cảng. Điều vô lý ở chỗ, cảng chỉ 20 USD/container 20 feet, còn chủ tàu đã thu tới 60 - 70 USD. Container 40 feet đáng lẽ chỉ chịu phí 35 USD cũng bị thu đội lên 100 - 120 USD. Ngoài việc thu cao, còn cần phải nói đến nhiều loại phí rất vô lý vẫn đổ lên đầu các chủ hàng Việt
"Đây cũng là một trong số nguyên nhân khiến các mặt hàng nhập về thị trường Việt
Bộ GTVT kiến nghị cần có chính sách khuyến khích phát triển đội tàu trong nước, nâng cao cơ sở hạ tầng để tránh việc đối tác nước ngoài vin vào cớ này để bắt chẹt DN trong nước. Trước mắt, Bộ GTVT cũng đề nghị Hiệp hội chủ hàng Việt Nam và Phòng Thương mại Công nghiệp Việt Nam chủ trì hiệp thương, đàm phán về giá với các chủ tàu để tiến tới một thị trường giá cước và các loại phí minh bạch hơn