Mô hình hoạt động của VNE gồm ba phần: sàn giao dịch, trung tâm thanh toán bù trừ, trung tâm kiểm định và giao dịch hàng hóa. Hàng hóa được Link Đăng Ký & Đăng Nhập Trang Chủ OK9 tại các sàn giao dịch phải qua giám định đạt những tiêu chuẩn về chất lượng.
Tổng Giám đốc VNE Nguyễn Duy Phương cho biết, mục tiêu của VNE là thu hẹp tình trạng chênh lệch giá giữa hàng hóa Việt