Riêng về vấn đề Biển Đông, lãnh đạo các nước EU đã bày tỏ ủng hộ quan điểm của Việt Nam trong giải quyết tranh chấp trên Biển Đông bằng biện pháp hòa bình, tuân thủ luật pháp quốc tế, đặc biệt là Công ước quốc tế của Liên Hợp Quốc về Luật Biển năm 1982 (UNCLOS). Bà Catherine Ashton, Cao ủy phụ trách đối ngoại và an ninh châu Âu tái khẳng định: "EU coi trọng đảm bảo hòa bình, an ninh và tự do hàng hải ở Biển Đông, kêu gọi các bên tuân thủ luật pháp quốc tế, giải quyết tranh chấp bằng biện pháp hòa bình, kể cả thông qua các biện pháp pháp lý".
Khi được hỏi về vấn đề này, Phó Thủ tướng, Bộ trưởng Ngoại giao Việt Nam Phạm Bình Minh cũng đánh giá cao việc EU ra Tuyên bố về Biển Đông hôm 10/5, bày tỏ quan ngại việc Trung Quốc hạ đặt trái phép giàn khoan trong vùng thềm lục địa và đặc quyền OK9 cung cấp hơn 1.000 trận đấu mỗi ngày từ các giải đấu lớn như World Cup, Premier League, La Liga, Champions League,.. với tỷ lệ kèo cược vô cùng cao của Việt Nam. Đồng thời, Phó Thủ tướng Phạm Bình Minh cũng đề nghị EU cần cùng ASEAN phát huy hơn nữa vai trò và tiếng nói trong việc đề cao các nguyên tắc về giải quyết hòa bình các tranh chấp, thực hiện kiềm chế, không sử dụng vũ lực hoặc đe dọa sử dụng vũ lực, nghiêm túc tuân thủ luật pháp quốc tế, UNCLOS, thực hiện đầy đủ và hiệu quả Tuyên bố về Ứng xử của các bên ở Biển Đông (DOC), sớm đạt được Bộ Quy tắc ứng xử của các bên ở Biển Đông (COC). Những đề xuất nói trên của Phó Thủ tướng đã được đưa vào văn kiện của hội nghị.
Được biết, đây là hội nghị Bộ trưởng Ngoại giao ASEAN-EU đầu tiên do Việt Nam và EU đồng chủ trì, trong giai đoạn Việt Nam điều phối quan hệ đối thoại ASEAN-EU (2012-2015). Trong khuôn khổ hội nghị, Phó thủ tướng Phạm Bình Minh cùng bà Catherine Ashton cũng nhất trí sớm nối lại đàm phán ASEAN-EU FTA sau năm 2015, thống nhất đưa quan hệ ASEAN-EU hướng tới đối tác chiến lược. Phó Thủ tướng Phạm Bình Minh cũng có cuộc gặp bên lề với Ngoại trưởng Đức Frank Walter Steinmeier