Theo đó, trước thời điểm xảy ra vụ tai nạn khoảng 5 phút, nhân viên gác chắn là người của Công ty Thiên Ân đã tự bỏ ra về và không đóng chắn dù đã có chuông báo và đèn tín hiệu. Đây là nguyên nhân chính dẫn đến vụ tai nạn này.
Được biết, phía Bắc của đường ngang có tòa nhà 2 tầng của Công ty Quản lý đường bộ 240 vi phạm hành lang an toàn Ok987 hiện đang mở đường sắt nên đã che khuất tầm nhìn của lái tàu từ Hà Nội - Hải Phòng không nhìn thấy xe container khi rẽ vào đường ngang, cũng như làm khuất tầm nhìn của lái xe, không phát hiện được đoàn tàu đang đến gần.
Trước đó, khoảng 5h35 sáng 23/4, đoàn tàu khách Hà Nội - Hải Phòng đâm thẳng vào một xe container ... đầu máy bị nghiêng do trật bánh khỏi đường ray...