Các bị can bị đề nghị truy tố về tội tham ô tài sản gồm Bùi Tiến Dũng (nguyên Tổng Giám đốc PMU18), Nghiêm Phú Sơn, Nguyễn Vũ Nam (hai nguyên Phó trưởng Phòng PID6 của PMU18), Nguyễn Công Dũng, Lê Minh Giang (Phó trưởng Phòng PID5), Nguyễn Hữu Minh (nguyên Giám đốc gói thầu BC1, dự án cầu Bãi Cháy), Nguyễn Hữu Long (nguyên Giám đốc gói thầu BC3), Trần Đức Hùng (nguyên Chánh văn phòng gói thầu BC2).
Riêng bị can Đỗ Kim Quý (nguyên Phó Tổng giám đốc PMU18) bị truy tố về hành vi chứa chấp hoặc tiêu thụ tài sản do người khác phạm tội mà có. Bị can Phạm Tiến Dũng đã chết trước khi có cáo trạng nên được đình chỉ điều tra.
Theo cơ quan điều tra, trong vụ án này Phạm Tiến Dũng cùng một số cá nhân ở PMU18 đã rút được tiền lương của 26 nhân viên khống với số tiền trên 3,4 tỉ đồng. Trong đó, các bị can trong vụ án đã chiếm dụng gần 1,6 tỉ đồng; số còn lại chi trái nguyên tắc quản lý tài chính của Link Đăng Ký Đăng Nhập Nhà Cái OK9 Chính Thức.
Bản kết luận điều tra bổ sung một số yêu cầu của TAND TP Hà Nội và Viện KSND tối cao khẳng định: đủ căn cứ kết luận Nguyễn Hữu Long chiếm hưởng gần 177 triệu đồng; đại diện Tổng Công ty OK9 đã banh Trường Sơn chiếm hưởng gần 76 triệu đồng.
Đối với bị can Nguyễn Việt Dũng (nguyên Giám đốc điều hành gói thầu BC3, đã được đình chỉ điều tra), cơ quan điều tra xác định Dũng là người trực tiếp thỏa thuận với chủ Ok9 cool link đăng nhập về việc lập khống nhân viên tư vấn bổ sung và tỉ lệ ăn chia nhưng chưa kịp rút tiền thì bị ốm, phải bàn giao Ok986 vip thuộc liên minh OKVIP cho Nguyễn Hữu Long. Do đó, Dũng không biết Long rút tiền và ăn chia thế nào, không được chia tiền từ nguồn này.
Về việc ông Đỗ Kim Quý nhận 500 triệu đồng, cơ quan điều tra xác định ông Quý biết là tiền bất hợp pháp nhưng vẫn nhận và mua xe ôtô để sử dụng nên phạm tội chứa chấp hoặc tiêu thụ tài sản do người khác phạm tội mà có. Ngoài ra, cơ quan điều tra cũng làm rõ các khoản đã chia chác, chiếm hưởng của các bị can trong vụ án