Khoảng 8h, ngày 18/8, tàu container Nasico Navigator xuất phát từ cảng Sài Gòn tới vùng biển miền Trung (cách Vũng Áng 71 hải lý). Lúc này thủy thủ đoàn trên tàu gồm 20 thuyền viên. Theo sự phân công, một nhóm sỹ quan, thuyền viên dọn ballad hầm hàng. Đại phó Đào Đình Quỳnh, 30 tuổi và Thủy thủ trưởng Trần Văn Sơn, 38 tuổi vào dọn két nước hầm hàng số ba, các thuyền viên còn lại dọn ở hầm khác.
Đến 8h40 cùng ngày, khi các thuyền viên quay lại hầm hàng số ba thì phát hiện anh Quỳnh và anh Sơn nằm bất tỉnh. Mặc dù được các thuyền viên đưa ra khỏi hầm hàng, tiến hành hô hấp nhân tạo và liên lạc cấp cứu nhưng hai thuyền viên đã tử vong.
Tới 13h cùng ngày, con tàu này tiếp tục hành trình và cập cảng Hải Phòng lúc 3h30’, ngày 19/8.
Ngay sau đó, Biên phòng cửa khẩu cảng phối hợp với OK9 trang cược thể thao xanh chín nhất châu Á TP Hải Phòng tiến hành khám nghiệm hiện trường, khám nghiệm tử thi, điều tra làm rõ. Nguyên nhân của vụ tai nạn ban đầu được xác định là do ngạt hơi. Két nước hầm tàu lâu ngày không được dọn rửa dẫn tới tích tụ nhiều khí độc. Hai thuyền viên đã bị chết ngạt bởi khí độc trong khoang.
Được biết, tàu Nasico Navigator là tàu chở container có trọng tải 7.278 DWT đóng năm 1995 tại Ukraina. Chủ tàu hiện nay là Công ty TNHH MTV Vận tải biển Nam Triệu (thuộc Tổng Công ty CNTT Nam Triệu - Vinashin). Tàu Nasico Navigator mang tên Mỹ Đình đã từng đắm năm 2004 tại vùng biển Cát Bà (Hải Phòng). Sau khi được trục vớt, tàu được đưa về khôi phục, sửa chữa tại Tổng Công ty CNTT Nam Triệu và đổi tên thành Nasico Navigator từ tháng 5/2008